南通大学药学院由原南通医学院药理学系和药学系组建而成。1984年开始培养药理学硕士研究生，2003年开始招收药学专业本科生。近十年来，药学院依托南通大学基础医学（学科群）优势，在药理学龙头学科的引领下，借助于飞速发展的苏中经济与高度发达的江苏医药行业，现已建成为国内高素质优秀药学人才的培养基地。
学院学科发展强势，药学一级学科建设处于领先水平（在南通大学所有专业学院中名列前十），现拥有药学一级学科硕士学位授权点（涵盖药理学、药剂学、微生物与生化药学、药物化学、药物分析、生药学等全部二级学科），另拥有药学、药剂学等3个本科专业（含成人教育）。本学院研究生与本科生招生生源丰富，毕业生就业前景光明。
学院师资队伍优化，教学水平一流。药学院现具有一支素质优良、作风严谨的学术队伍，汇集药理学、药物化学、药物分析学、药剂学、生药学、中药学、微生物与生化药学等专业科技人才。现有专任教学科研人员34人，其中教授6人，副教授10人，高级实验师1人，讲师12人，助研与实验师6人，研究生导师15人，其中：博士26人（在专任教师中占90%），硕士5人，已形成了一支结构较为合理的教学队伍和高层次的学术研究梯队。
学院科研力量雄厚，实验条件完善。近五年来先后主持承担国家、省部及市厅各类各级纵向课题36项（其中主持国家基金项目的教师有13人，主持省部级基金项目7项，主持市厅级基金项目16项，主持国家和省部级基金项目的教师达50%以上）。医|学教|育网整理一流学科药理学系南通市生物医药研究重点实验室依托学科，其《生物医药重点实验室》和《药学中心实验室》先后被列为南通市科技基础设施建设计划和中央与地方共建计划专项，学院实验室现有建面近1600M2，实验室环境与设施达到国内领先水平。
打造“江苏医药大省、医药强省”系国务院和江苏省人民政府的重大战略决策。江苏省药学类专业人才培养70%以上来源于苏南高校，而为江苏医药经济作出巨大贡献的医药产业基地近70%则位于苏中苏北（医药经济占全省的3/5）。南通大学滨江临海，地理上位于苏北南通大学网络教育药学，经济区域归属苏中，可谓苏中、苏北经济发展的门户，具有独特的地域优势。为苏中苏北医药卫生事业培育高素质优秀药学人才、服务地方经济，系南通大学药学院义不容辞的责任，也是省委、省政府对苏中苏北实施科技优先扶持政策的要求。展望未来，药学院将紧跟时代发展步伐南通大学网络教育药学，顺应医药行业发展潮流，为培养具有国际视野和创新能力的高素质优秀药学人才做出新的贡献！
